中国医学科学院成立于1956年，北京协和医学院成立于1917年，中国医学科学院北京协和医学院自1957年起实行院校合一的管理体制，是我国最高医学研究机构和最高医学教育机构。

院校始终牢记初心使命，以引领我国医学科技教育发展和维护人民健康为己任，教育人才辈出，科研硕果累累，医疗领衔行业，为我国现代科学医学体系的建立和发展做出了重要贡献。院校已发展成为拥有19个研究所、6家附属医院、9所学院、106个院外研发机构，集医教研产为一体的国家级综合性医学科学研究机构。